| NIPT （NIFTY/NIPS）是利用孕婦血液中的胎兒游離DNA篩檢胎兒異常，主要被用來篩檢三種常見的體染色體異常：唐氏症（T21）、愛德華氏症（T18）、巴陶氏症（T13），2015 年英國Diana Bianchi教授和研究團隊首度發現，從非侵入性胎兒染色體基因檢測檢測異常 ，出現多重染色體倍數變異的情況（ Multiple Copy Number Variation） 或檢測無效的案例中，有數名為罹患惡性腫瘤的確診個案，初步證實孕期腫瘤會造成 NIFTY/NIPT 檢測異常的結果。 |
非侵入性胎兒染色體基因檢測（NIFTY/NIPT）分析為多重染色體倍數變異的現象可能和母體腫瘤有關？
2019年4月一篇跨區域、多種族、大規模數據的研究成果發表在Nature系列期刊《Genetics in Medicine》，收集來自新加坡、伊朗、中國、香港、台灣、丹麥、西班牙和斯洛維尼亞等地超過193萬例的臨床研究，驗證在非侵入性胎兒染色體基因檢測（NIFTY/NIPT）出現多重染色體倍數變異的現象和母體腫瘤有關。
193萬例接受非侵入性胎兒染色體基因檢測的孕婦當中，有639位的分析結果出現多重染色體異常的拷貝數變異（Copy Number Variation;CNV）訊號，扣除97位失聯無法追蹤的個案以外，此篇研究共追蹤訪查了542位受檢者，其中有41名受檢者在進行詳細的醫學檢查之後，經由醫師確認診斷罹患惡性腫瘤（癌症）， 其中，確認為乳癌者佔10位（24.4%）、淋巴癌9位（22%）、肝癌9位（22%）、消化道癌症（胃癌）4位（9.8%）、大腸直腸癌3位（7.3%）、卵巢畸胎瘤1位（2.4%）、鼻咽癌（NPC, Nasopharyngeal Carcinoma）1位（2.4%）、肺癌1位（2.4%）、平滑肌肉瘤（Leiomyosarcoma, LMS）1位（2.4%）、生殖細胞瘤（dysgerminoma）1位（2.4%）、子宮頸癌1位（2.4%）。此外，還有有4位受檢者則是確診患有子宮肌瘤（Leiomyomas）、1位受檢者患有卵巢巧克力囊腫。
41位確診罹癌的受檢者中，統計有8位（19.5%）為第二期癌、9位（22%）為第三期癌、19位（46.3%）為第四期癌，過半檢出罹癌的患者屬於癌症中晚期，可能因中晚期的腫瘤較大，釋放較多的ctDNA，而較容易被偵測出多重CNV的信號。即便如此，也並非所有多重染色體倍數變異（Multiple CNV）的結果都是惡性腫瘤所造成，以本次收案結果統計，639名當中僅有42位受檢者確認診斷罹癌，陽性預測率（PPV）僅約7.6%，用來預測母體腫瘤的存在其專一性仍然偏低。
此外，研究團隊從542名（41名確診罹癌，501名未罹癌）追蹤訪查的受檢者當中發現FCNV（Fraction of significant CNVs）數值有非常明顯的差異，進而編寫成CDP（Cancer Detection Pipeline）演算法，其檢測敏感性（sensitivity）可達83%、特異性（specificity）達84.2%； 陽性預測率（PPV）與陰性預測率（NPV）則分別為30.1%與 98.4%，相較於僅用多重CNV來預測腫瘤，此套CDP演算法將專一性顯著提升。未來若檢測出異常多重CNV的情況時，可望透過演算法的優化，提供臨床醫師與受檢者更加精準的參考數據，用做後續醫療方向參考。
註：FCNV=明顯異常出現CNV的游離DNA片段數量/所有游離DNA片段的總數量
| 項目 | 敏感性（sensitivity） | 特異性（specificity） | 陽性預測率（PPV） | 陰性預測率（NPV） |
| 數值 | 83% | 84.2% | 30.1% | 98.4% |
參考文獻： 表一、演算法優化後各項統計數據
2.Sequencing of Circulating Cell-free DNA during Pregnancy. N Engl J Med. 2018 Aug 2;379(5):464-473.
文章最後更新時間：2019/05/22
(#台灣基康022)
